Der zentrale Fokus im Projekt liegt auf dem rund 550 Kilometer umfassenden Netz aus Quellbächen und Bachoberläufen. Prioritäres Projektziel ist es, für das gesamte Gewässernetz des projektbezogenen Planungsraums (mit Ausnahme der Talsperren) eine ökologische Durchgängigkeit herzustellen. Dabei werden die angrenzenden Auen, Moore, Bergwiesen und Wälder in die Gesamtkonzeption mit einbezogen.

Bei den Mooren liegt der Schwerpunkt auf dem Erhalt und der Wiederherstellung zahlreicher kleinerer Waldmoore, die in der Regel in enger Verzahnung mit den Bergwiesen und Quellbächen vorhanden sind. Der Rückbau von Entwässerungsanlagen und die Wiedervernässung von etwa 75 Moorstandorten bilden den wesentlichen Schwerpunkt der Maßnahmen. Stellenweise wird die Entwicklung standortgerechter Moorwälder gefördert, um die ökologische Funktion der Moore zu verbessern. Ziel ist die Wiederherstellung eines naturnahen Wasserregimes mit möglichst langer Speicherung des Wassers.

Der Planungsraum liegt fast vollständig im UNESCO-Biosphärenreservat Thüringer Wald sowie teilweise in FFH-Gebieten und Vogelschutzgebieten.

Das Projekt gliedert sich in zwei Phasen:

1. Planung und Moderation: 2021-2025
2. Umsetzung: 2025-2035